Haré modelado de proteínas para acoplamiento y dinámica.

La selección y preparación de la estructura 3D de la proteína objetivo es la clave para un experimento exitoso de acoplamiento molecular y/o simulación de dinámica molecular.

Puedo proporcionar los siguientes servicios:

1. Seleccione la(s) proteína(s) objetivo a través de una búsqueda bibliográfica.
2. Refinar la estructura 3D (cuando se proporciona un archivo pdb o un ID de PDB)
3. Modelado de homología de modelo suizo a partir de secuencia FASTA o UniProt ID
4. Modelado por homología de modeladores
5. I-TASSER para modelado ab initio

## Las estructuras 3D derivadas experimentalmente están disponibles en diferentes bases de datos, como

1. Informe preliminar del RCSB
2. EBI
3. PDBJ
4. Suma de PDBS

## También se pueden encontrar estructuras de alta calidad derivadas computacionalmente en

PLEGABLE ALFA

## Cuando las estructuras 3D no están disponibles en las fuentes anteriores, podemos preparar estructuras utilizando el modelado de homología de Swissmodel. Sin embargo, necesitamos la secuencia de aminoácidos (FASTA) de la proteína objetivo. Por lo general, recuperamos la secuencia de la base de datos UniProt. En ese caso, deberíamos tener el ID UniProt de la proteína objetivo.