Haré aprendizaje automático, acoplamiento y dinámica molecular.
Nivel 2
Ha cumplido con los criterios de alto rendimiento y tiene un historial comprobado de cumplimiento de las expectativas de los clientes.
Acerca de este Servicio
Básico
Aprendizaje automático
Generación de datos de actividad de ligandos a partir de ChEMBL/PubChem
(máximo 3 bioensayos, máximo 1K ligandos)
Modelos tradicionales de aprendizaje automático (bosque aleatorio, regresión logística, refuerzo de gradiente, etc.)
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Estándar
Básico +
ADMET +
Acoplamiento molecular
Selección de objetivos
Refinamiento de la estructura 3D
Acoplamiento AutoDock Vina (acoplamiento ciego)
(máximo 100 ligandos)
Partituras vinculantes, lista ordenada
Figuras profesionales (los tres primeros éxitos, pose de atraque)
------------
De primera calidad
Estándar +
Red neuronal de aprendizaje profundo +
Predicción del sitio de unión
Modelado de homología
Acoplamiento molecular específico del sitio
(máximo 1000 ligandos)
Interacciones proteína-ligando 2D
Figuras profesionales (top tres éxitos, pose de atraque, interacciones)
+
Simulaciones de dinámica molecular (Gromacs)
Tres complejos, dos réplicas de cada uno
Máximo 100K átomos (cada sistema)
Generación de entrada, minimización, equilibrio NVT, equilibrio NPT, ejecuciones de producción
RMSD, RMSF, radio de giro, enlace de hidrógeno, SASA
Energía libre de enlace (MM-PBSA/MM-GBSA)
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Si es necesario, solicite más detalles antes de realizar el pedido.
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Z zonera0167

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3 días
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D 
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