Haré aprendizaje automático, acoplamiento y dinámica molecular.

Básico

Aprendizaje automático

Generación de datos de actividad de ligandos a partir de ChEMBL/PubChem

(máximo 3 bioensayos, máximo 1K ligandos)

Modelos tradicionales de aprendizaje automático (bosque aleatorio, regresión logística, refuerzo de gradiente, etc.)

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Estándar

Básico +

ADMET +

Acoplamiento molecular

Selección de objetivos

Refinamiento de la estructura 3D

Acoplamiento AutoDock Vina (acoplamiento ciego)

(máximo 100 ligandos)

Partituras vinculantes, lista ordenada

Figuras profesionales (los tres primeros éxitos, pose de atraque)

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De primera calidad

Estándar +

Red neuronal de aprendizaje profundo +

Predicción del sitio de unión

Modelado de homología

Acoplamiento molecular específico del sitio

(máximo 1000 ligandos)

Interacciones proteína-ligando 2D

Figuras profesionales (top tres éxitos, pose de atraque, interacciones)

+

Simulaciones de dinámica molecular (Gromacs)

Tres complejos, dos réplicas de cada uno

Máximo 100K átomos (cada sistema)

Generación de entrada, minimización, equilibrio NVT, equilibrio NPT, ejecuciones de producción

RMSD, RMSF, radio de giro, enlace de hidrógeno, SASA

Energía libre de enlace (MM-PBSA/MM-GBSA)

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Si es necesario, solicite más detalles antes de realizar el pedido.