I will do machine learning, docking and molecular dynamics

Parte de la información aparece en idioma inglés.
5.0
5.0

Bangladesh

Hablo Inglés

30 pedidos completados

I have over 15 years of experience in life sciences in the USA, Japan, and Bangladesh. I have published over 30 research articles in renowned international peer-reviewed journals, including Nature, Sc...

Nivel 2

Ha cumplido con los criterios de alto rendimiento y tiene un historial comprobado de cumplimiento de las expectativas de los clientes.

Acerca de este Servicio

Basic

Machine Learning

Generation of ligand activity data from ChEMBL/PubChem

(max 3 bioassays, max 1K ligands)

Traditional Machine Learning Models (Random Forest, logistic regression, gradient boosting, etc.)

-----------

Standard

Basic +

ADMET +

Molecular Docking

Target selection

3D structure refinement

AutoDock Vina docking (blind docking)

(max 100 ligands)

Binding scores, sorted list

Professional figures (top three hits, docking pose)

------------

Premium

Standard +

Deep Learning Neural Network +

Binding site prediction

Homology Modeling

Site-specific Molecular Docking

(max 1000 ligands)

2D protein-ligand interactions

Professional figures (top three hits, docking pose, interactions)

+

Molecular Dynamics Simulations (Gromacs)

Three complexes, Two replicates of each

Max 100K atoms (each system)

Input generation, Minimization, NVT equilibration, NPT equilibration, Productions runs

RMSD, RMSF, Radius of Gyrate, H-bond, SASA

Binding Free Energy (MM-PBSA/MM-GBSA)

---------

Please ask for further details if needed before ordering.

Lenguaje de programación:

Python

R

Tecnología:

Excel

Tipo de análisis:

Análisis cuantitativo

Análisis cualitativo

Experiencia:

Algoritmos

Predicción

probabilidad

Herramientas:

Otros

Reseñas

1 comentarios sobre este Servicio
5.0

(1)
(0)
(0)
(0)
(0)
Desglose de calificaciones
  • Nivel de comunicación del Freelancer
    5
  • Calidad de la entrega
    5
  • Valor de la entrega
    5
Ordenar por
Más relevante
  • Z
    image-docs

    zonera0167

    GB

    Reino Unido

    5

    A talented Fiver star .I highly recommended.Close your eyes and place your order with out

    Hasta USD50

    Precio

    3 días

    Tiempo

    Útil?
    No
Reseñas

1 comentarios sobre este Servicio
5.0

(1)
(0)
(0)
(0)
(0)
Desglose de calificaciones
  • Nivel de comunicación del Freelancer
    5
  • Calidad de la entrega
    5
  • Valor de la entrega
    5
Ordenar por
Más relevante
  • Z
    image-docs

    zonera0167

    GB

    Reino Unido

    5

    A talented Fiver star .I highly recommended.Close your eyes and place your order with out

    Hasta USD50

    Precio

    3 días

    Tiempo

    Útil?
    No