Analizaré tus datos de metilación de ADN y epigenética

Analizo datos de epigenética: metilación del ADN (con arrays o secuenciación bisulfito/enzimática), ChIP-seq y ATAC-seq, y los convierto en resultados que puedas interpretar y poner en un artículo.

Para datos de metilación, trabajo tanto con datos basados en arrays (Illumina 450k/EPIC) como con datos de secuenciación (WGBS, RRBS, EM-seq), ya que el enfoque de análisis difiere significativamente entre ambos y te diré cuál es relevante para tu tipo de datos. Esto generalmente incluye control de calidad, normalización, análisis de metilación diferencial entre grupos y anotación de regiones significativas a genes o características genómicas.

Para ChIP-seq y ATAC-seq, el flujo de trabajo abarca alineación de lecturas, llamada de picos y análisis de accesibilidad o unión diferencial, con visualización de las pistas de señal y anotación de picos.

En todos los casos, el resultado está diseñado para ser interpretable: gráficos claros, un resumen de a qué corresponden biológicamente las regiones o picos significativos, y suficiente documentación del método para que pueda integrarse directamente en una sección de métodos.

Escríbeme con el tipo de datos y el diseño del estudio antes de hacer el pedido para confirmar el alcance y ofrecerte una cotización precisa.