Explorar las categorías
Explora
Fiverr Pro
Español
$
USD
Haré análisis de expresión diferencial de RNA-seq en r con deseq2
Transformando datos biológicos en ideas útiles
Soy especialista en investigación computacional con una licenciatura en Biotecnología y formación a nivel de maestría en Bioquímica Médica, con experiencia en biostatística, bioinformática y modelado ...
Acerca de este Servicio
Soy un biólogo computacional con una maestría en Bioquímica Médica y experiencia en investigación en A*STAR Singapur. Realizo análisis de RNA-seq para investigadores que tienen los datos y necesitan que alguien los interprete.
LO QUE OBTIENES
- Expresión diferencial con DESeq2, correctamente especificada para tu diseño
- Figuras listas para publicación a 300 dpi, en PNG y PDF
- Una tabla de resultados que puedes incluir directamente en un archivo suplementario
- El script de análisis, anotado, para que tú o tu laboratorio puedan volver a ejecutarlo
- Una interpretación escrita, incluyendo lo que los datos NO respaldan
POR QUÉ IMPORTA EL ÚLTIMO PUNTO
Los revisores preguntan por qué filtraste en un umbral determinado, si ajustaste por lote y por qué se excluyó alguna muestra. Todo lo que entrego está documentado para que puedas responder esas preguntas.
VÉASE EL ESTÁNDAR ANTES DE COMPRAR
Un análisis completo, con código, figuras y advertencias, es público:
github.com/kND-17/hgsoc-origin-rnaseq
LO QUE NECESITO DE TI
Tu matriz de conteos (o archivos FASTQ), una hoja de metadatos de las muestras y una oración sobre qué quieres descubrir. Escríbeme antes de ordenar si no estás seguro de qué paquete es el adecuado y te diré con honestidad.
Dominio:
Otros
Experiencia:
Otros
Lenguaje de programación:
Python
•
R
•
SQL
Herramientas:
Jupyter Notebook
•
Excel
Tecnología:
Python
•
R
•
Pandas
•
RStudio
Mi porfolio
FAQ
Traducción automática
¿Puedes trabajar desde archivos FASTQ en crudo?
Sí, ese es el paquete Premium. Los paquetes Básico y Estándar asumen que ya tienes una matriz de conteos.
Mis datos son no publicados y confidenciales. ¿Es eso un problema?
No. No comparto ni reutilizo datos de clientes, y puedo eliminarlos después de la entrega si lo solicitas.
¿Seré autor en el artículo?
Solo si quieres que lo sea. La autoría o reconocimiento es completamente tu decisión y nunca es una condición.
¿Qué pasa si el análisis no encuentra nada significativo?
Aún así obtienes el análisis completo, las figuras y una interpretación honesta de lo que muestran los datos. Un resultado nulo también es un resultado, y no ajustaré umbrales para fabricarlo.
¿Puedes manejar datos de single-cell?
No en este servicio. Escríbeme y te diré si puedo ayudarte o te remitiré a alguien que sí pueda.
