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Analizaré transcriptómica de secuenciación de ARN de célula única y multi-ómicas
Bioinformática, Escritura Científica y Análisis de Datos
Soy biólogo y candidato a doctorado con experiencia en biología molecular, bioinformática, análisis de datos, I+D en biotecnología, escritura científica y apoyo en investigación. Ayudo a investigadore...
Acerca de este Servicio
Ayudo a investigadores, estudiantes y equipos de biotecnología a analizar datos de transcriptómica, ARN-seq de célula única y multi-ómicas con resultados claros, reproducibles y biológicamente significativos.
Puedo trabajar con ARN-seq en masa, ARN-seq de célula única, matrices de expresión génica, conjuntos de datos GEO, tablas de proteómica procesada y otros conjuntos de datos biológicos que requieran análisis de expresión diferencial, agrupamiento, genes marcadores, enriquecimiento de vías o descubrimiento de biomarcadores.
Dependiendo de tu proyecto, puedo ofrecer resúmenes de control de calidad, PCA, UMAP, agrupamiento, gráficos de volcán, mapas de calor, análisis de expresión diferencial, enriquecimiento GO/KEGG, genes candidatos, interpretación biológica, código reproducible en R/Python y un informe estructurado.
Mi formación como biólogo y candidato a doctor me permite conectar los resultados computacionales con un contexto biológico real, no solo entregar gráficos o tablas.
Para archivos FASTQ en crudo, conjuntos de datos grandes de célula única o proyectos complejos de multi-ómicas, por favor contáctame antes de hacer el pedido para que pueda revisar el tipo de datos, el diseño experimental y la viabilidad.
Dominio:
Otros
Experiencia:
Otros
Lenguaje de programación:
Python
•
R
Herramientas:
Otros
Tecnología:
Python
•
R
•
Jupyter Notebook
•
RStudio
Modelos y métodos:
Otros
Otros servicios de Ciencia de datos y aprendizaje automático que ofrezco
FAQ
Traducción automática
¿Qué tipo de datos de omics puedes analizar?
Puedo trabajar con ARN-seq en masa, ARN-seq de célula única, matrices de expresión génica, conjuntos de datos GEO, tablas de proteómica procesada y otros conjuntos de datos biológicos, dependiendo del formato y el objetivo.
¿Analizas archivos FASTQ en crudo?
El análisis de archivos FASTQ en crudo está disponible solo tras discusión, ya que depende del tamaño del archivo, número de muestras, necesidades de control de calidad y el pipeline requerido. Por favor, contáctame primero.
¿Puedes trabajar con conjuntos de datos públicos de GEO?
Sí. Puedo ayudar a analizar conjuntos de datos públicos de GEO u otros repositorios similares si los datos están disponibles, bien anotados y son adecuados para el análisis solicitado.
¿Analizas datos de ARN-seq de célula única?
Sí. Puedo trabajar con datos de ARN-seq de célula única usando Seurat o Scanpy, incluyendo control de calidad, agrupamiento, UMAP, genes marcadores e interpretación biológica.
¿Puedes analizar datos de proteómica?
Sí, si proporcionas tablas de abundancia de proteínas procesadas, tablas de intensidad LFQ o resultados normalizados de proteómica. Los archivos de espectrometría de masas en crudo no están incluidos como paquete estándar.
¿Puedes garantizar genes significativos o biomarcadores?
No. Los resultados dependen del tamaño de la muestra, la calidad de los datos, el diseño experimental y la señal biológica. Ofrezco un análisis riguroso, pero no puedo garantizar hallazgos específicos.
Qué necesitas para empezar?
Necesito tu conjunto de datos, metadatos o información de muestras, etiquetas de grupo, pregunta de investigación, resultados esperados y cualquier herramienta o formato preferido.
¿Proporcionas código?
Sí. Dependiendo del paquete, puedo proporcionar código reproducible en R o Python, scripts o un cuaderno con el flujo de trabajo del análisis.
¿Debo comunicarme con usted antes de realizar el pedido?
Sí. Los proyectos de bioinformática varían mucho, por lo que es mejor revisar tu tipo de datos, diseño y entregables esperados antes de comenzar.
