Haré análisis de rnaseq en masa con expresión génica diferencial, go y análisis de vías.

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Consultor científico

Doctor en Bioingeniería. Licenciado en Biología Molecular en la universidad, trabajé con nanopartículas por un tiempo, luego en cultivo de tejidos y más tarde en Organ-on-chip. Actualmente trabajo com...
Acerca de este Servicio

¿Tienes datos de RNA-seq y necesitas resultados claros y defendibles?

Realizaré un pipeline de RNA-seq en R/Python completamente reproducible y entregaré figuras listas para publicación con un informe de interpretación experto para que puedas pasar directamente de datos en bruto a la siguiente sección de tu manuscrito.

  • Control de calidad y revisión de diseño: revisión de metadatos, validación de réplicas, detección de valores atípicos y PCA
  • Análisis de expresión diferencial: DESeq2 o edgeR con corrección FDR (BenjaminiHochberg)
  • Figuras listas para publicación: volcán, MA, PCA, mapa de calor agrupado, gráficos de puntos/burbujas de vías
  • Enriquecimiento funcional: GO (BP/MF/CC) ± KEGG/Reactome mediante g:Profiler o clusterProfiler
  • Tablas de datos organizadas: recuentos normalizados, valores estabilizados por varianza y tablas de DEG (CSV/XLSX)
  • Informe detallado: HTML o PDF con métodos completos, parámetros e interpretación en lenguaje sencillo


Lo que necesito de ti:

Opción A: archivos FASTQ + hoja de muestras

Opción B: matriz de recuento en bruto (genes × muestras) + hoja de muestras

Humano, ratón, rata o cualquier otro, solo avísame.


Por favor, ten en cuenta:

Los resultados son solo para fines de investigación, no se hacen afirmaciones clínicas o diagnósticas. Todos los datos se manejan de forma confidencial y no se comparten con terceros.

Tecnología:

Jupyter Notebook

RStudio

Tipo de análisis:

Análisis cuantitativo

Análisis cualitativo

Experiencia:

Otros

Lenguaje de programación:

Python

R

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