Explorar las categorías
Explora
Fiverr Pro
Español
$
USD
Realizaré control de calidad, recorte y alineación de datos ngs usando galaxy
Estudiante de MPhil, experto en bioinformática y descubrimiento de fármacos
Soy estudiante de MPhil especializado en bioinformática y nanobiotecnología.
Conecto la brecha entre el descubrimiento de fármacos por computadora y la síntesis en laboratorio. Con experiencia en doc...
Acerca de este Servicio
¿Necesitas ayuda para procesar tus datos de secuenciación NGS en crudo? Ofrezco control de calidad confiable, recorte y alineación usando la plataforma Galaxy para que obtengas datos limpios y listos para análisis sin tener que aprender la pipeline tú mismo.
Lo que puedo hacer:
Recuperar datos de secuenciación de NCBI/SRA (fasterq-dump)
Ejecutar FastQC para evaluación de calidad
Recortar y limpiar lecturas (Trimmomatic)
Alinear lecturas a un genoma de referencia (Bowtie2, HISAT2)
Proporcionar un resumen claro de los resultados
También trabajo con varias otras herramientas de Galaxy además de estas si tu proyecto necesita algo específico, envíame un mensaje primero y confirmaré si puedo ayudar.
Estoy en las primeras etapas de mi camino como freelancer con experiencia práctica en control de calidad, recorte y alineación de NGS, una excelente opción para proyectos sencillos a un precio accesible.
Nota: Mejor para conjuntos de datos pequeños a medianos (por ejemplo, secuenciación dirigida, experimentos de small RNA-seq). Para conjuntos de datos muy grandes, envíame un mensaje primero para confirmar la viabilidad.
Envíame los detalles de tu conjunto de datos (organismo, tipo de secuenciación, tamaño del archivo) antes de ordenar y confirmaré el tiempo de entrega.
Mi porfolio
FAQ
Traducción automática
¿En qué formato debo enviarte mis datos?
Archivos FASTQ, o un número de acceso SRA si tus datos están disponibles públicamente en NCBI.
¿Qué tamaño de conjunto de datos puedes manejar?
Trabajo mejor con conjuntos de datos pequeños a medianos (por ejemplo, secuenciación dirigida, small RNA-seq). Para conjuntos de datos más grandes, envíame un mensaje primero para confirmar la viabilidad dado los límites de almacenamiento del servidor Galaxy.
¿Proporcionas archivos de salida en crudo o un informe resumen?
Recibirás ambos: los archivos de salida procesados y un resumen claro que explica las métricas de calidad y cualquier problema encontrado.
¿Qué pasa si mis datos necesitan una herramienta no listada en tu gig?
Envíame un mensaje con los detalles antes de ordenar — trabajo con varias otras herramientas de Galaxy y puedo confirmar si puedo ayudar.
¿Puedes ayudar a interpretar los resultados, no solo generarlos?
Sí, puedo incluir una breve explicación de lo que significan los resultados de QC/alineación para tu conjunto de datos específico.
