Realizaré docking molecular y cribado virtual


Acerca de este Servicio
Traducción automática
Investigador de MPhil especializado en acoplamiento molecular de alta precisión y cribado virtual.
¿Necesitas modelado computacional listo para publicación para tu tesis o investigación? Ofrezco servicios expertos de descubrimiento de fármacos in silico usando protocolos estándar de la industria para garantizar precisión geométrica y estabilidad de unión.
Servicios que ofrezco:
- Acoplamiento molecular: acoplamiento proteína-ligando usando AutoDock Vina, PyRx y CB-Dock2.
- Cribado virtual: cribado de alto rendimiento de bibliotecas químicas para identificar compuestos líderes.
- Visualización 3D: renderizados de alta resolución y mapeo de interacciones usando PyMOL/Discovery Studio.
- Análisis post-acoplamiento: evaluación exhaustiva de afinidades de unión (kcal/mol) y estabilidad de enlaces de hidrógeno.
- Informe técnico: análisis detallado listo para publicación en revista o defensa académica.
¿Por qué elegir mis servicios?
- Rigor académico: resultados formateados para cumplir con los estándares de revistas de categoría W.
- Experiencia en software: dominio en PyMOL, GROMACS y suites AutoDock.
- Validación: protocolos que incluyen redocking para garantizar un umbral RMSD de menos de 2.0 Å.
Por favor, envíame un mensaje con los detalles de tu proteína (ID PDB) y ligando antes de hacer el pedido para discutir tus objetivos específicos del proyecto.
Conoce a Anabia M.
MPhil Scholar, Bioinformatics and Drug Discovery Expert
- DePakistán
- Miembro desdeoct 2025
- Responde aprox. en:1 hora
Idiomas
Inglés, Urdu
Traducción automática
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FAQ
Traducción automática
¿Qué archivos necesito proporcionar?
Por favor, proporciona: Proteína objetivo (ID PDB o archivo). Ligandos (formato SDF o MOL2). Información de la caja de cuadrícula: si tienes coordenadas específicas (X, Y, Z) y dimensiones, por favor proporciónalas. De lo contrario, especifica los residuos del sitio activo o si debo realizar un acoplamiento ciego.
¿Qué software utilizas para el docking?
Principalmente uso AutoDock Vina y CB-Dock2, pero puedo adaptarme a otras herramientas específicas si son necesarias para tu proyecto.
¿Puedes proporcionar figuras de calidad para publicación?
¡Sí! Uso Discovery Studio para crear gráficos de interacción en 3D y 2D de alta resolución listos para revistas.
¿Ofreces simulaciones de dinámica molecular (MD)?
Mis paquetes estándar se centran en el acoplamiento, pero puedo realizar simulaciones MD como una oferta personalizada. Por favor, envíame un mensaje para discutir la duración de la trayectoria.

