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Haré análisis de expresión diferencial en RNA seq y gráficos de deseq2
Analista de Bioinformática en RNA Seq, acoplamiento molecular y simulaciones MD
Soy un biólogo computacional especializado en transcriptómica RNA-Seq, acoplamiento molecular y simulaciones de acoplamiento molecular. Trabajo con pipelines en Linux Bash, R (DESeq2/Bioconductor), Py...
Acerca de este Servicio
¡Bienvenido a mi servicio de Biología Computacional y Transcriptómica!
¿Buscas análisis precisos y listos para publicación de datos de secuenciación de ARN (RNA-Seq)? Ofrezco pipelines transcriptómicos completos usando herramientas estándar de biología computacional en Linux Bash, R y Python.
Servicios que ofrezco:
Control de calidad y recorte (FastQC, Trimmomatic)
Alineación de lecturas con reconocimiento de empalmes (HISAT2)
Cuantificación de genes (featureCounts)
Análisis de expresión diferencial (DESeq2 en R)
Visualizaciones de alta resolución (volcano plots, heatmaps agrupados, PCA)
Análisis de enriquecimiento funcional (análisis de vías GO y KEGG)
Lo que recibirás:
1. conjuntos de datos limpios y tablas de Excel anotadas con DEGs, cambios en pliegues y valores p ajustados.
2. gráficos en formato vectorial/PNG de alta resolución (más de 300 DPI) listos para publicación.
3. scripts de R reproducibles y bien comentados.
4. informe analítico en PDF con resumen.
Por favor, contáctame antes de hacer tu pedido para discutir el tamaño de tu conjunto de datos y los requisitos del proyecto.
Mi porfolio
FAQ
Traducción automática
¿Qué archivos de entrada necesito proporcionar?
Puedes proporcionar archivos FASTQ en crudo o una matriz de conteo de genes junto con tu tabla de diseño experimental (muestras control vs tratadas).
¿Recibiré el código R reproducible?
Sí, se proporcionan scripts completos y limpios en los paquetes estándar y premium con comentarios para total transparencia y reproducibilidad.
