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Realizaré acoplamiento molecular y cribado virtual para tu proyecto
Acerca de este Servicio
¿Estás trabajando en un proyecto de descubrimiento de fármacos y necesitas resultados confiables y reproducibles de docking molecular? Ya seas investigador, estudiante de doctorado o parte de un pequeño equipo de biotecnología, puedo realizar un flujo de trabajo completo de docking y entregarte resultados claros, listos para publicación.
Tengo experiencia práctica en ejecutar pipelines de diseño de fármacos basado en estructuras (SBDD), incluyendo un estudio completo de docking con 5 ligandos contra la proteasa principal del SARS-CoV-2 (PDB: 7SFB), por lo que sé exactamente cómo debe ser un estudio de docking riguroso y bien documentado.
Lo que haré por ti:
- Preparar tu objetivo proteico (eliminar moléculas de agua, añadir hidrógenos y cargas Gasteiger)
- Preparar y optimizar tu(s) ligando(s) (minimización de energía, conversión de formato)
- Definir el sitio de unión / caja de grid para docking
- Ejecutar docking usando AutoDock Vina o PyRx
- Visualizar las poses de unión y las interacciones clave en PyMOL o Discovery Studio
- Entregar un informe escrito claro con puntuaciones de docking y análisis de interacciones
Los entregables incluyen:
- Archivos de salida de docking (PDBQT / SDF)
- Visualizaciones de poses de unión de alta calidad (PNG)
- Resumen escrito de resultados con interpretación
Herramientas utilizadas: AutoDock Vina, PyRx, PyMOL, UCSF Chimera, Discovery Studio
Tipo de servicio:
Investigación
Idioma:
Árabe
•
Inglés
Preferencia de estilo de entrega
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