Realizaré análisis de metagenómica, microbioma, secuenciación de rna

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Bioinformático experto, NGS, RNA Seq y análisis de metagenómica

Soy un bioinformático profesional con gran experiencia en análisis de datos de NGS. Me especializo en secuenciación metagenómica, shotgun metagenomics y análisis de microbioma 16S/18S/ITS. Ofrezco aná...
Acerca de este Servicio

Realizaré análisis experto en bioinformática, RNA-Seq, scRNA-Seq, metagenómica y datos de NGS.

Como bioinformático profesional, entrego análisis de alta calidad y reproducibles para proyectos de investigación, académicos y de la industria. Ya sea que tengas datos de secuenciación en bruto o necesites conocimientos biológicos profundos, convertiré tus datos en resultados claros y listos para publicación.

Servicios incluyen:

  • Análisis de RNA-Seq en masa y de RNA-Seq de célula única (scRNA-Seq): expresión diferencial de genes, agrupamiento, enriquecimiento de vías
  • Análisis de metagenómica y microbioma (16S rRNA, ITS, metagenómica de disparo, perfil taxonómico y análisis de diversidad)
  • Procesamiento de datos de NGS / WGS, llamada de variantes y anotación
  • Análisis de expresión génica, transcriptómica y anotación funcional

Herramientas y tecnologías:

  • R / Bioconductor: DESeq2, edgeR, Seurat, clusterProfiler, limma
  • QIIME2, Mothur, Kraken2, MetaPhlAn
  • Python: Scanpy, Pandas, Biopython
  • Herramientas de alineación y control de calidad: FastQC, Trimmomatic, STAR, HISAT2

Entregables:

  • Informes completos de control de calidad y preprocesamiento
  • Figuras y visualizaciones de calidad de publicación (heatmaps, gráficos de volcán, PCA, árboles filogenéticos, etc.)
  • Informe completo en HTML/PDF con resultados estadísticos e interpretación biológica


Tecnología:

Excel

Google Data Estudio

Hojas de cálculo de Google

Tipo de análisis:

Análisis cuantitativo

Análisis cualitativo

Experiencia:

Diseño de experimentos

Algoritmos

Pronóstico

Lenguaje de programación:

Python

R

SPSS

SQL

Java

Mi porfolio

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