Haré análisis de datos de bioinformática usando python y r

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Bioinformático, Desarrollador en Python

Soy un bioinformático y desarrollador en Python con tres años de experiencia diseñando aplicaciones y pipelines para procesar y visualizar datos de bioinformática. Tengo experiencia con Flask, FastAPI...
Acerca de este Servicio

Soy un bioinformático y desarrollador en Python/R con más de 5 años de experiencia procesando conjuntos de datos NGS y desarrollando flujos de trabajo analíticos. Coautor de 15 publicaciones revisadas por pares (Genome Medicine, Epigenetics & Chromatin).


Servicios:

  • Análisis de datos NGS: WGS/WES (GATK, priorización de SNP, detección de variantes), RNA-seq (DESeq2), ChIP-seq (ChIPseeker), y Hi-C/Exo-C (Juicer, Juicebox).
  • Scripting en bioinformática: Scripts personalizados y desarrollo de pipelines en Python (Pandas, NumPy, scikit-learn) y R (Bioconductor).
  • Herramientas y entornos: BLAST, BWA, Bowtie2, SAMtools, Picard, Docker, Conda, Bash.
  • Visualización de datos: Figuras listas para publicación usando Matplotlib, Seaborn, Plotly y ggplot2.

Entregables:

  • Datos de secuencias procesados y archivos de variantes (VCF, BAM, BED, matrices de conteo).
  • Código limpio, documentado y configuraciones de entornos reproducibles.
  • Informes resumidos con figuras e interpretaciones de datos.


Por favor, contacta conmigo antes de hacer un pedido para discutir la estructura de tus datos y los requisitos del proyecto.

Tecnología:

Python

•

RStudio

Experiencia:

Clasificación

•

agrupación

•

Extracción de Datos