Soy un bioinformático y desarrollador en Python/R con más de 5 años de experiencia procesando conjuntos de datos NGS y desarrollando flujos de trabajo analíticos. Coautor de 15 publicaciones revisadas por pares (Genome Medicine, Epigenetics & Chromatin).
Servicios:
- Análisis de datos NGS: WGS/WES (GATK, priorización de SNP, detección de variantes), RNA-seq (DESeq2), ChIP-seq (ChIPseeker), y Hi-C/Exo-C (Juicer, Juicebox).
- Scripting en bioinformática: Scripts personalizados y desarrollo de pipelines en Python (Pandas, NumPy, scikit-learn) y R (Bioconductor).
- Herramientas y entornos: BLAST, BWA, Bowtie2, SAMtools, Picard, Docker, Conda, Bash.
- Visualización de datos: Figuras listas para publicación usando Matplotlib, Seaborn, Plotly y ggplot2.
Entregables:
- Datos de secuencias procesados y archivos de variantes (VCF, BAM, BED, matrices de conteo).
- Código limpio, documentado y configuraciones de entornos reproducibles.
- Informes resumidos con figuras e interpretaciones de datos.
Por favor, contacta conmigo antes de hacer un pedido para discutir la estructura de tus datos y los requisitos del proyecto.